Bio Data Analyst · Clinical / Spatial & Single-cell / Bulk RNA-seq · Seoul · KR

임상·오믹스 데이터를
출판 가능한 논문으로
만듭니다.

서울대학교 생명과학부 학부·대학원 출신, wet-lab과 dry-lab을 모두 경험한 바이오 데이터 분석가.

임상 데이터와 raw sequencing 파일을 받아, 최신 통계 방법론과 R·Python 분석 패키지, AI 에이전트 기반 워크플로우로 분석부터 publication-ready figure, 논문 초안, 투고 전략까지 한 명의 분석가가 직접 책임집니다. 모든 결과는 사람이 검증합니다.

SNUSeoul National Univ.생명과학부 학부·대학원
Wet + DryFull-stack실험부터 생물정보 분석까지
AI + HumanAgent workflowAI 에이전트 가속 · 분석가 검증
1:1Single analyst접수부터 초안까지 1인 전담
  • 1–2 영업일무료 검토·견적 회신
  • NDA계약 체결 후 착수
  • IRB기관 규정 준수
  • R · Python재현 가능한 분석
  • 서울·수도권현장 방문 미팅
§ 01ABOUT · 분석가 소개
JHK Jong-Hwi Kim

김종휘

JONG-HWI KIM
바이오 데이터 분석가 · MediBioDraft
LinkedIn ↗

서울대학교 생명과학부에서 학부와 대학원 과정을 수련했으며, 실험(wet-lab)과 전산 분석(dry-lab)을 모두 직접 수행해 왔습니다.

임상의, 대학원생, 연구실 PI를 대상으로 임상·Spatial & Single-cell·Bulk RNA-seq 데이터를 명확한 결과와 publication급 figure, 논문 초안으로 정리합니다. 데이터가 만들어지는 과정을 이해하기 때문에 시퀀싱 전 실험 설계와 분석 후 검증 실험까지 함께 자문할 수 있습니다.

고전적 생물통계부터 딥러닝 기반 single-cell 모델까지 새로 발표되는 방법론과 패키지를 지속적으로 추적·적용하며, 문헌·데이터베이스 탐색, 파이프라인 개발, 코드 검토에 최신 AI 에이전트를 적극 활용합니다. AI로 속도를 높이되, 모든 수치·figure·주장은 전달 전 직접 검증합니다.

CREDENTIALS & TOOLING

EDUCATION서울대학교생명과학부 학부·대학원
EXPERTISEWet & Dry lab실험부터 생물통계·생물정보까지
LANGUAGESR · Python · BashBioconductor · scverse · Nextflow
STATISTICS임상 생물통계 전반생존분석 · 인과추론 · 혼합모형 · 베이지안
OMICSSingle-cell · Spatial · BulkSeurat v5 · scvi-tools · DESeq2
AI AGENTSClaude Code · MCP문헌·DB 탐색 및 코드 개발 에이전트
REPRODUCIBILITYGit · Docker · conda코드·실행 환경 버전 관리 및 전달
VISUALIZATIONPrism · BioRender · FigmaFigure, graphical abstract, 포스터
MEETINGOnline · On-site서울·수도권 현장 방문
COMPLIANCENDA · IRBCOPE / ICMJE 기준 준수
§ 02SERVICES · 서비스

Raw data부터
논문 초안까지.

데이터 종류와 연구 목적에 맞춰 분석 범위를 설계합니다. 데이터 생성 전 단계에서 실험 목적에 맞는 설계 자문도 가능합니다.

01 / CLINICAL DATA→

임상 데이터 분석

코호트·후향적 임상 데이터를 통계적으로 분석해 임상적으로 의미 있는 스토리를 도출합니다.

  • 기술 통계 · 그룹 간 비교
  • 생존분석 (Kaplan-Meier, Cox regression)
  • 다변량 회귀 · 예후 모델링
  • 공개 데이터(GEO, TCGA) 교차 검증
02 / SPATIAL & SINGLE-CELL→

Spatial & Single-cell RNA-seq

Raw FASTQ 또는 h5ad/h5 파일부터 QC, 클러스터링, 세포유형 주석까지 전 과정을 진행합니다.

  • QC · MAD 기반 필터링 (scverse 기준)
  • Clustering · cell-type annotation · DEG
  • Batch correction · 통합 (scVI, scANVI)
  • Trajectory · cell-cell interaction
03 / BULK RNA-SEQ→

Bulk RNA-seq 분석

nf-core 표준 파이프라인으로 정량한 뒤 차등발현·경로 분석을 수행합니다.

  • 정렬 · 정량 (nf-core/rnaseq)
  • DEG (DESeq2 / edgeR) · GSEA
  • Volcano plot · correlation matrix
  • 임상 변수와의 통합 분석
04 / MANUSCRIPT & CONSULTING→

논문 · 컨설팅

결과를 투고 가능한 형태로 정리하고, 온라인 또는 연구실·병원 현장에서 설명합니다.

  • Publication-ready figure (300 DPI+) · graphical abstract
  • 논문 초안 · 타겟 저널 · 투고 전략
  • 학회 포스터 · 발표 자료 (대본 포함)
  • 랩미팅 발표 · 후속 검증 실험 설계 자문
§ 03METHODS · 분석 역량

최신 방법론을,
근거 있게 선택합니다.

통계·오믹스 방법론은 매달 새로 발표됩니다. 최신 패키지와 벤치마크 연구를 지속적으로 검토해, 연구 질문과 데이터에 가장 적합한 방법을 선택 근거와 함께 제안합니다.

01 / STATISTICS & CLINICAL

임상 생물통계

연구 설계에 맞는 모형을 선택하고, 가정 검토와 민감도 분석까지 수행합니다.

METHODS
생존분석 (KM, Cox PH, time-varying Cox) 경쟁위험 (Fine–Gray) 성향점수 (PSM, IPTW) 혼합효과 모형 · GEE 다중대체 (MICE) 예측모형 · nomogram · ROC / DCA 베이지안 모형 검정력 · 표본수 산정
PACKAGES
survivalrmslme4MatchItWeightItmicebrmstidymodelslifelinesstatsmodels
02 / SINGLE-CELL & SPATIAL

Single-cell · Spatial 오믹스

Raw 데이터부터 통합·주석·기능 해석까지 최신 커뮤니티 표준 도구로 처리합니다.

METHODS
Ambient RNA · doublet 제거 통합 · batch correction 자동 cell-type annotation Trajectory · RNA velocity Cell-cell communication Gene regulatory network Spatial deconvolution · niche 분석 Multiome (RNA + ATAC)
PACKAGES
ScanpySeurat v5scvi-toolsHarmonyCellBenderscDblFinderCellTypistscVeloCellRankCellChatLIANA+pySCENICSquidpycell2locationSignacArchR
03 / BULK & MULTI-OMICS

Bulk · Multi-omics

표준 파이프라인 분석과 공개 코호트 재분석을 통한 검증까지 연결합니다.

METHODS
정렬 · 정량 차등발현 Pathway · GSEA · GSVA Co-expression network Immune deconvolution 공개 코호트 재분석 (TCGA, GEO) 멀티오믹스 통합
PACKAGES
nf-core/rnaseqSTARSalmonDESeq2edgeRlimma-voomfgseaclusterProfilerGSVAWGCNAComBat-seqBayesPrismTCGAbiolinksMOFA+
04 / MACHINE LEARNING

머신러닝

해석 가능한 예측 모형과 biomarker 선별을 학습 데이터 밖에서까지 검증합니다.

METHODS
변수 선택 (LASSO, elastic net) 앙상블 (random forest, gradient boosting) Nested CV · 외부 검증 모델 해석 (SHAP) 딥러닝 표현 학습
PACKAGES
scikit-learnglmnetXGBoostLightGBMSHAPPyTorch
05 / REPRODUCIBILITY

재현 가능한 전달

모든 분석을 다시 실행 가능한 코드와 고정된 실행 환경으로 남깁니다.

PRACTICES
버전 관리 컨테이너 실행 환경 파이프라인 자동화 코드 포함 분석 리포트
TOOLS
Gitconda / uvDockerNextflowSnakemakeQuartoJupyterrenv
방법 선택의 근거벤치마크와 원 논문을 기준으로 선택하고, 그 이유를 Methods에 명시합니다.
가정 · 민감도 검토통계 가정을 확인하고, 대안 모형으로 결과의 안정성을 점검합니다.
완전한 추적성코드, 패키지 버전, random seed를 결과와 함께 전달합니다.
AI-AUGMENTED · HUMAN-VERIFIED

최신 AI 에이전트로 더 빠르고 넓게.
검증은 끝까지 사람이.

AI 코딩 에이전트와 MCP로 연결된 생의학 데이터베이스를 분석 전 과정에 활용합니다. 반복 작업에 드는 시간을 줄이고, 그만큼 연구 질문과 해석에 집중합니다.

01문헌 · 근거 탐색PubMed, bioRxiv, ClinicalTrials.gov를 에이전트로 체계적으로 탐색해 선행연구와 연구 공백을 정리합니다.
02타깃 · 약물 DB 연계Open Targets, ChEMBL, UniProt, STRING, Reactome 조회로 결과의 생물학적 맥락을 보강합니다.
03파이프라인 개발코딩 에이전트로 분석 코드를 빠르게 구축·리팩터링하고, 테스트로 오류를 줄입니다.
04분석가 검증모든 코드·수치·figure·인용은 직접 확인합니다. 환자 식별 정보는 외부 AI 서비스에 입력하지 않습니다.
AGENTS & CONNECTED SOURCES
Claude CodeMCPPubMedbioRxivClinicalTrials.govOpen TargetsChEMBLUniProtSTRINGReactome
§ 04ENGAGEMENT · 이용 안내

무료 검토 후
프로젝트별 견적.

데이터 규모(샘플 수, 시퀀싱 depth), 분석 복잡도, 집필 범위에 따라 산정합니다. 견적 확인 후 진행 여부를 결정하시면 됩니다.

BASIC

단일 데이터셋 분석

맞춤 견적
  • Bulk RNA-seq QC · 차등발현 분석
  • 임상 데이터 기초 통계
  • Publication-ready figure 3–5종
  • 분석 리포트 (PDF)
STANDARD 가장 많이 찾는 구성

분석 + 논문 방향 제안

맞춤 견적
  • Spatial & Single-cell / Bulk 심층 분석
  • 임상 통합 분석 (생존분석 등)
  • 스토리라인 · 초록 초안
  • 온라인 컨설팅 1회
PREMIUM

논문 초안 + 현장 컨설팅

맞춤 견적
  • 임상 + 오믹스 통합 분석
  • 논문 초안 전체 (Intro–Discussion)
  • 타겟 저널 · 투고 전략
  • 현장 방문 컨설팅

* 모든 데이터는 IRB·기관 규정에 따라 처리하며, 비밀유지계약(NDA) 체결 후 착수합니다.

§ 05FAQ · 자주 묻는 질문
01어떤 데이터를 보내야 하나요?

임상 데이터는 엑셀/CSV, RNA-seq은 raw FASTQ·count matrix·h5ad/h5 파일 모두 가능합니다. 형식을 정확히 모르셔도 접수 후 함께 확인합니다.

02IRB 승인 전에도 접수할 수 있나요?

가능합니다. 임상·인체유래물 raw 데이터 전달 전에는 IRB 승인이 필요하지만, 승인 전에도 접수와 프로토콜 자문은 받으실 수 있습니다.

03대필인가요? 저자 지위는 어떻게 되나요?

아닙니다. 분석과 초안은 연구 지원 서비스로 제공되며, 저자가 모든 결과와 주장을 직접 검토·승인하고 원고에 대한 책임을 집니다. 지원 사실은 저널 정책에 따라 명시하고, 공동저자 또는 사사 여부는 ICMJE 기준에 따라 사전에 협의합니다. 미표기 대필, 명의 저자, 저자 자격 매매는 제공하지 않습니다.

04현장 미팅은 어디까지 가능한가요?

서울·수도권은 직접 방문하며, 그 외 지역은 화상 미팅(Zoom / Google Meet) 또는 별도 협의로 진행합니다.

§ 06INQUIRY · 무료 상담 신청

데이터 개요를 보내주시면
1–2 영업일 내 회신합니다.

데이터 종류, 연구 질문, 희망 일정을 알려주세요. 대용량 raw 파일(FASTQ 등)은 접수 확인 후 보안 업로드 링크로 전달받습니다.

01
접수데이터 종류 · IRB 현황 · 연구 배경
02
무료 검토 · 견적분석 범위 · 일정 · 비용 안내
03
NDA · 분석보안 전달, QC → 분석, 중간 공유
04
결과 전달 · 미팅Figure · 초안 · 투고 전략 논의
LOCATION서울 · 온라인 전국
SECURITYNDA 후 데이터 전달 · IRB 준수
데이터 종류 (중복 선택)
임상·인체유래물 raw 데이터는 IRB 승인 확인 후에만 전달받습니다. 승인 전에도 접수와 프로토콜 자문은 가능합니다.
개인정보 수집·이용 안내자세히

수집 항목 이름, 소속, 이메일, 연락처, 연구 배경 및 요청 내용, IRB 승인 현황

수집 목적 상담 신청 확인, 분석 견적 산정, 컨설팅 일정 조율

보유 기간 상담 종료 후 6개월간 보관 후 파기 (계약 체결 시 관계 법령에 따른 기간 동안 보관)

임상 데이터·인체유래물 관련 raw 파일은 본 접수 단계에서 수집하지 않으며, IRB 승인 확인 후 별도의 보안 채널로만 전달받습니다.

귀하는 개인정보 수집·이용에 동의하지 않을 권리가 있으며, 미동의 시 상담 신청 진행이 제한될 수 있습니다.

제출 정보는 상담·분석 목적 외에 사용하지 않으며, 필요 시 별도 NDA를 체결합니다.